הסיפור מתרחש ביפן כאשר מדען יפני המציא שלד לחימה שנקרא Infinite Stratos או בקיצור IS אשר בקלות יכול להביס את ירביו. בעזרת פיתוח עצמי של מדינות אחרות הנשק הופך להיות הנשק המרכזי בעולם ובעזרתו נוצר שלום. אבל היחידות שיכולות להפיל את ה-IS הן הנשים ובכך ...