על רקע המאה ה- 26, אליטה היא אדם-מכונה נשית שהתגלתה על ידי מדעןבחצר גרוטאות. המדען הרחום מבין מיד כי מאחורי המעטפת החיצונית של הסייבורג, קיימת אישה צעירה בעלת נשמה ולב רחב עם עבר יוצא דופן. הוא מנסה להגן עליה, בעוד ידידה הוגו דווקא מנסה להעיר את זיכרונה מחייה הקודמים. זה קורה כאשר סביבתה התומכת מאוימת על ידי כוחות מושחתים וקטלניים. אליטה משתמשת במומחיותה באמנות הלחימה, והופכת לציידת ראשים, בדרך להציל את העולם אותו למדה לאהו