ווילי הלווייתן חוזר, הפעם מאויים ע”י ציידי לוויתנים לא-חוקיים שמרוויחים כסף מסושי. ג’סי, כעת בן 16, התחיל לעבוד על ספינת מחקר הלווייתן הקטלן, יחד עם ידידו משכבר הימים רנדולף ומדען עוקצני, דרו. על ספינת ציידי הלווייתנים ישנו רב-חובל ג’ון ווסלי ובנו, מקס, אשר אינו כל-כך מרוצה מעבדותו של אביו, אך אין לו האומץ להביע את רגשותיו. במהלך הדרך, ווילי מתאחד מחדש עם ג’סי, שעוזר למקס להבין שלוויתנים הם קצת יותר מסתם צ’יזבורגר